新生儿吃整肠生有可能会出现副作用，但是也是因人而异的。
新生儿的各个器官发育不是太完善，如果肝脏器官还没有完全发育好的情况下，身体内的消化酶分泌不足，如果再吃整肠生的时候，有可能会出现便秘或者是腹泻，还有大便干燥等不良的副作用，如果新生儿免疫力低下，还有可能会出现皮肤容易过敏的情况，导致皮肤发红或者是瘙痒等症状。
整肠生是一种益生菌，可以起到调节胃肠道菌群的作用，对缓解新生儿出现腹泻有治疗的效果，但是在服用整肠生的药物时，需要谨遵医嘱，不要自己在家盲目用药，以免产生一些不良的副作用。另外还要注意做好新生儿腹部的保暖，避免着凉，哺乳期间的母亲不要吃油腻以及刺激性的食品，比如炸鸡腿或者是辣椒、生姜等。
