包皮過長的危害主要有三點：第一、白色的包皮垢堆積在包皮內，會長期刺激龜頭，甚至可以導致陰莖癌。第二、容易引起包皮龜頭炎反覆發作，可以導致包皮縮窄，不能上翻成為包莖。
另外，有醫學科學家研究發現，在非洲行包皮環切術後的男性和女性有性行為時吶大大降低了艾滋病通過女性傳染給男性的風險目前吶，醫學界也認為包皮環切術後可以降低幾種性傳播疾病的感染風險，反過來理解。從統計角度看，相對於包皮長度正常的人，包皮過長的男性在和攜帶病原體的異性有不潔性生活時，感染性病的機率要增大。
