流感潛伏期打流感疫苗，可能會加重疾病症狀。另外，由於流感潛伏期身體會較虛弱，打流感疫苗後，容易誘發疫苗的副作用，或是影響到疫苗的效果。
1、加重病情
流感潛伏期時通常免疫力低下，由於受到致病菌感染可引起肌肉痠痛、渾身無力等症狀，而流感疫苗大多數屬於減毒活疫苗，流感潛伏期接種流感疫苗，可能導致病情加重，容易使流感恢復時間延長，治療難度增加。
2、誘發疫苗的副作用
在流感潛伏期，身體抵抗能力減弱，在打流感疫苗以後，容易導致注射部位產生腫脹和疼痛，嚴重的時候還可能會出現感染的現象，感染的機率有所增加，所以流感潛伏期應儘量避免打流感疫苗。
3、影響疫苗效果
在流感潛伏期打流感疫苗，由於身體較虛弱，可能會導致體內不能完全產生抗體，影響到藥物的發揮，達不到抗病的能力。
若是有接種疫苗需求的患者在接種之前應該先諮詢醫生，由醫生判斷是否能夠接種。一般建議感冒痊癒之後再打流感疫苗，在流感潛伏期應該多喝溫熱水，可以促進體內的代謝，注意休息，避免受涼，有利疾病儘早恢復。
