一般情況下，乙肝干擾素打了三個月停藥的後果主要有乙肝病毒複製增加、療效降低、病情加重等。具體分析如下：
1、乙肝病毒複製增加
如果乙肝患者在使用干擾素治療期間停藥，會使得乙肝病毒有可能重新開始複製。停藥後的一段時間內，免疫系統可能還未完全恢復，這時候病毒複製的可能性會更高。此外，如果幹擾素的使用時間過短或用量不足，可能會導致病毒無法完全被清除，停藥後病毒複製的風險也會增加。
2、療效降低
如果停藥，乙肝病毒很可能會再次開始複製。停藥後，機體免疫系統的抵抗力可能會下降，無法繼續有效地清除病毒。此外，病毒在體內存在的時間越長，對免疫系統的抑制作用就越強，使得治療難度增加。
3、病情加重
干擾素的治療作用是通過激活免疫系統抑制乙肝病毒的複製，而乙肝病毒是一種具有高度變異性的病毒，可以快速地適應和抵抗干擾素的作用，進而恢復自身的複製活性。因此，一旦停止干擾素治療，乙肝病毒就會重新開始複製，導致病情加重。
除此之外，患者還可能會出現免疫力下降的情況。患者在接受干擾素治療期間，應該嚴格按照醫生的要求進行用藥，不要自行停藥，以免影響療效並導致病情加重。
