做試管的無創產前檢查主要是在懷孕12-27周之間抽取孕婦的外周血，採用新一代測序技術，對於母體血漿內遊離的胎兒DNA片段進行測序，檢查胎兒發生非整倍體的風險，主要是用來檢測21三體、18三體和13三體這三種最爲常見的染色體疾病。
試管嬰兒可以做無創DNA檢查，即使雙胎也可以考慮做無創DNA檢查，但是雙胎妊娠無創基因檢查，21三體、18三體和13三體檢出的例數比較少，這點需要加以考慮。此外，無論試管嬰兒有無做植入前遺傳基因檢測，也應該按照正常的產前篩查和產前診斷流程來進行，必要時還是需要做無創檢查。
經過試管嬰兒助孕的孕婦準備做無創產前篩查時，需在懷孕11周前確定爲單胎，並且在確定單胎8周後，才能抽血去做無創產前篩查。此外，對於經過三代試管嬰兒助孕的孕婦，一定要進行產前診斷，不能單純只選擇無創產前篩查。
