枕大池蛛網膜囊腫手術有一定的危險，但是危險性比較小。
枕大池蛛網膜囊腫多數情況下是先天性的發育異常，屬於良性疾病，增長比較緩慢或不會增長，不需要特殊治療。但有少數枕大池蛛網膜囊腫，由於體積比較大，容易對周圍組織造成壓迫，還容易引起腦積水或癲癇，出現頭暈、噁心、嘔吐、意識障礙等症狀，需採取手術治療，手術可選擇微創治療，創傷比較小，手術的危險係數也比較低。部分患者無法採取微創手術治療，需採取開放性手術將囊腫切除，手術有一定的危險性，但危險性通常不是很大，術後若癒合比較良好，一般7天左右可拆線。
另外，枕大池蛛網膜囊腫手術前，需要接受全身體格、血常規、凝血功能、心電圖等檢查，排除手術禁忌症降低手術發生危險的機率。
