在手足口病或者皰疹性咽峽炎流行的期間，不要去人羣集中的地方，在家裏地面、桌、椅、牀、櫃、門把手等各種物體表面要做好衛生清潔。兒童衛生應注意勤洗手、洗澡，勤換洗衣物，勤晾曬被褥。嬰兒的奶嘴、奶瓶煮沸消毒20分鐘之後再使用，兒童的玩具要定期的消毒。
每天開窗通風至少2～3次，每次不少於30分鐘，目前已經有腸道病毒EV71滅活疫苗了，可預防EV71病毒感染引起的皰疹性咽峽炎、手足口病以及無菌性腦膜炎等等，可以減少皰疹性咽峽炎、手足口病的重症和死亡病例的發生。
腸道病毒71型也就是EV71滅活疫苗的接種對象，爲6月齡到5歲兒童。基礎免疫程序爲2劑次，間隔時間1個月，目前是否需要進行加強免疫還未確定，通常我們1次1支(0.5ml)，推薦在上臂三角肌處接種，有條件者可以考慮給寶寶接種。
