上廁所會疼需要結合其他臨牀診斷，然後在醫生的指導下，對症治療。考慮是外痔血栓形成、肛裂、肛周膿腫、肛管部位腫瘤、泌尿系統感染等原因導致，治療期間不要吃辛辣刺激食物，飲食清淡爲主。
1、外痔血栓形成
外痔血栓形成在初期水腫不明顯看一看予以溫水高錳酸鉀坐浴，外用痔瘡膏，使用消除水腫的邁之靈一般能夠緩解，如果效果不好就要手術切除血栓。
2、肛裂
肛裂引起劇烈疼痛，也要軟化大便口服麻仁丸加前述外痔的治療方法坐浴和痔瘡栓。
3、肛周膿腫
肛周膿腫主要是持續的肛周疼痛和排便時加重還有皮膚的局部紅腫，要切開膿腫充分引起膿液後抗炎治療。
4、肛管部位腫瘤
肛管部位腫瘤伴有大便性狀異常要確診後根治性手術治療。
5、泌尿系統感染
泌尿系統感染會導致上廁所時尿路刺痛，多喝水，多排尿，吃消炎藥可以有效的改善。可以熱水敷下腹部，每天熱水、溫水坐浴，可以有效的清除炎症，緩解膀胱痙攣和小便疼痛。
如果每次上廁所都疼，建議儘早前往醫院泌尿外科門診，或者肛腸外科門診進行肛門檢查。平時患者需要調整飲食結構，避免使用辛辣、刺激的食物以及煎炸的食物。
