新生兒雙側室管膜下囊腫會不會自愈，一般可根據囊腫大小進行判斷。具體分析如下：
1、會自愈
新生兒雙側室管膜下囊腫通常是早產、胚胎層發育不良或外傷，顱內壓增高等原因引起。如果囊腫體積比較小，直徑不超過2釐米，沒有對腦組織造成壓迫，有可能會自愈，通常隨胎兒出生後會逐漸吸收。
2、不會自愈
如果囊腫直徑超過2釐米，並且體積持續增大，壓迫腦組織，通常不會自愈，可由專業醫生通過穿刺抽吸排出膿液或進行外科手術切除囊腫，促進腦部發育。
由於新生兒體質比較弱，建議到正規醫療機構，由專業醫生進行治療，以免造成身體損傷。
