吹薩克斯的害處有影響手指關節的健康、對孩子脊椎的影響、容易導致老人青光眼等。
1、影響手指關節的健康
指法對演奏薩克斯也很重要，正確的握姿與手指的鬆緊都會影響手指關節的健康。
2、對孩子脊椎的影響
薩克斯管的頸部掛帶，坐姿、站姿不正確會致使頸椎發生病變導致頸椎病的發生。孩子如果太小扛不起中音薩克斯的重量，對脊椎和手型會有一定影響太小的孩子建議從降B高音薩克斯管開始學，耗氣量和重量都比降E調中音薩克斯要小一些。
3、容易導致老人青光眼
吹薩克斯對於中老年人有較大的壞處，那就是用力過猛，容易導致繼發性青光眼，可以使用前房沖洗術。薩克斯是所有吹奏樂器中最需要用力，如果吹得太久，很可能會導致身體內部的壓力增大，從而導致眼部的細小血管受損，建議適當吹薩克斯。
此外，吹奏薩克斯會影響到人體的肺部，建議選擇合適自己的進行練習。
