爲了提高手足口病和嚴重急性呼吸道感染的監測預警能力，根據手足口病和嚴重急性呼吸道感染（SARI）的歷年疫情和實際監測工作成效，中心傳染病預防控制處對手足口病監測方案和SARI監測方案進行了調整。爲廣泛徵求各省意見，中心傳防處於2013年7月16-17日在北京召開了手足口病監測方案和SARI監測方案專家論證會，來自中心病毒病所、北京市、上海市、江蘇省、浙江省、湖南省、福建省、江西省、山東省和安徽省疾控中心負責相關疾病監測工作的流行病學和實驗室檢測業務骨幹參加了會議。
會上，中心傳防處詳細介紹了手足口病監測方案和SARI監測方案的內容，並與各省（市）專家對監測方案的技術環節逐一進行深入討論，包括監測目的、框架、病例定義、哨點醫院的選擇、病原學監測等。各省專家在會中還反饋了前期監測工作中面臨的問題和困難，爲監測方案的修訂提供了寶貴的意見和建議。
討論結束後，傳染病預防控制處餘宏傑處長對會議進行了總結，並對兩個監測方案的修訂提出了具體要求，希望按照專家的意見儘快對監測方案進行修改，提交衛生計生委審覈，儘早頒佈指導基層工作。
