在人體排泄系統中，腎臟是製造尿液的地方，輸尿管處在尿路的上游，尿道則是尿路的下游，可以將尿液排出體外。因此，除了以上因素外，女性生殖系統的各種疾病都有可能引起尿痛。
女性的尿道與陰道毗鄰而居，細菌很容易侵入陰道，特別是在性交過後，“蜜月性膀胱炎”就是因此而得來的。女性陰道與腸道、肛門鄰近，很多大腸細菌也會闖入陰道，引發尿路感染，導致尿痛。雖然女性尿路的表面上覆蓋着一層像似保護膜的粘液層，在正常情況下，陰道粘膜會滋生一種乳酸桿菌，使陰道呈酸性，可以抑制細菌侵入。但這些自然防禦功能因先天性缺乏或後天性改變時，容易引發陰道或尿路感染。
尿道炎直接影響排尿，其炎症細菌可在尿道擴散，是引起尿痛的主要因素之一。
女性宮頸內膜炎因宮頸有充血、水腫、觸之易出血、黃色粘液膿性分泌物增多以及下腹部不適等，這些與尿道息息相關的部位，都是引起尿痛的因素。
非特異性陰道炎的主要症狀是陰道上皮大量脫落，陰道粘膜充血，觸痛明顯，嚴重時出現全身乏力、小腹不適，白帶量多、呈膿性或漿液性，白帶外流刺激尿道口，嚴重引起尿痛。
在人體排泄系統中，腎臟是製造尿液的地方，輸尿管處在尿路的上游，尿道則是尿路的下游，可以將尿液排出體外。因此，除了以上因素外，女性生殖系統的各種疾病都有可能引起尿痛。
該症的突出症狀是白帶增多及外陰、陰道奇癢，陰道膜高度水腫，有白色片塊狀薄膜粘附，易剝離，此外受損粘膜的糜爛基底或形成淺潰瘍等，刺激尿道，引發尿痛。
這種常見於30～50歲的女性生殖器良性腫瘤，其症狀是下腹部有腫塊。這些腫塊上的細菌可能隨生殖道入侵尿道，引發尿痛。
