新生兒血小板低需要先明確原因，然後根據原因進行治療。常見原因有感冒、風疹、新生兒紫癜、小兒營養性缺鐵性貧血、新生兒同種免疫血小板減少症等。
1、感冒
新生兒感染腺病毒、鼻病毒等病原體發生感冒，通常會導致免疫系統下降，導致血液循環、血液成分發生變化，造成血小板水平偏低，其他伴隨症狀還有咳嗽、流鼻涕等。根據醫生指導合理使用抗病毒藥物，比如磷酸奧司他韋顆粒、鹽酸金剛烷胺糖漿、利巴韋林顆粒等有助於控制病情，改善症狀。
2、風疹
新生兒免疫力過於低下，如果感染風疹病毒引起風疹，通常會導致骨髓造血功能下降，使血小板水平下降，同時還可能會引起出疹、發熱等現象。一般需要針對症狀進行治療，比如體溫超過38.5℃，可使用布洛芬顆粒、對乙酰氨基酚顆粒、布洛芬混懸液等藥物調節體溫。
3、新生兒紫癜
出生時就存在比較明顯的維生素K缺乏現象，會導致出血傾向增加，造成血小板生成減少。通常需要在醫生的指導下使用止血類藥物，比如維生素K1注射液、酚磺乙胺注射液、氨甲苯酸注射液等進行止血，同時提高凝血酶原，促進病情好轉。新生兒用藥規範、禁忌比較多，如果沒有專用藥物時，使用其他藥物要嚴格遵醫囑或在醫生操作下使用，有助於減少藥物副作用。
4、小兒營養性缺鐵性貧血
是先天體內鐵元素不足導致紅細胞數量偏少引起的疾病，通常會影響到造血幹細胞、血小板等血液成分的含量，造成新生兒血小板比較低。另外，還會影響身體發育，出現體重偏低、不愛活動等現象。新生兒可以使用的鐵劑比較少，一般可在病情比較嚴重時合理使用葡萄糖酸亞鐵糖漿、右旋糖酐鐵顆粒、乳酸亞鐵口服液等補充鐵元素，改善症狀。
5、新生兒同種免疫血小板減少症
主要是母親和胎兒血小板的類型不匹配，導致母親血中的抗體攻擊胎兒血小板引起，會導致胎兒的血小板被破壞，出現新生兒血小板數量偏低的現象。遵醫囑使用重組人血小板生成素注射液、艾曲泊帕片、利妥昔單抗注射液等藥物，有助於促進血小板生成。雖然該類藥物不是特別適用於兒童，但在緊急救治時需要綜合考慮，以緩解病情、拯救生病爲主要目標。
新生兒血小板持續過低，對身體危害比較大，所以要及時治療，有助於延緩病情發展。
