亞低溫治療的併發症有肺部感染、循環系統併發症、電解質紊亂等症狀。
1、肺部感染
亞低溫治療降低了機體的體溫，使全身的基礎代謝處於低溫狀態，影響了體內各系統功能的正常發揮，易引起肺部感染的發生。
2、循環系統併發症
主要是低血壓及心律失常。鎮靜藥氯丙嗪具有擴張血管及降血壓的作用，易引起循環不穩及體位性低血壓。
3、電解質紊亂
常見的就是低鉀血癥，冷利尿導致電解質丟失，容易引起電解質紊亂，包括低鉀、低鎂和低磷酸鹽，低溫誘導期發生率最高，需嚴密監測。
亞低溫治療的併發症還有會出現凍瘡，建議亞低溫治療的患者需要密切觀察，提前預防。
