肝S2小囊腫是否嚴重需要根據實際情況決定，如果屬於良性囊腫，通常不嚴重；如果是惡性囊腫，此時比較嚴重，具體分析如下：
1、不嚴重
肝S2小囊腫是指肝臟S2肝段內的液體囊腫，多數爲良性囊腫，如果腫瘤較小，並未伴隨任何症狀，通常不需特殊治療，只需要定期隨訪觀察即可。建議每6個月或12個月進行一次B超以及CT檢查，以便及時發現是否有變化。
2、嚴重
但有一部分患者囊腫直徑超過3cm，並且出現了局部疼痛、腹脹，以及壓迫周圍組織和器官的情況，或者檢查出惡變的情況，可能是惡性囊腫，此時比較嚴重，如果治療不及時，可能會危及生命。治療時可通過膽囊切除手術、介入治療等方法治療。
平時要保持健康的生活方式，養成良好的生活習慣，定期到醫院複查。
