一般情況下，頭疼藥用於治療上呼吸道感染、偏頭痛、神經性頭痛等原因引起的頭疼，它不是特指某一種藥物，而是對具有止疼效果的藥物的總稱，頭疼藥的副作用可以分爲胃腸道反應、機體耐藥性反應、嗜睡等。
1、胃腸道反應：頭疼藥通常會對胃腸道產生一定的刺激，影響到胃腸道功能，如損傷到胃腸道黏膜還可能會誘發胃腸道病變，出現胃潰瘍、胃出血等疾病。
2、機體耐藥性反應：患者在出現頭疼後即吃頭疼藥通常會使機體內部產生抗藥性，後續不得加大藥量纔會有效果，這屬於頭疼藥的機體耐藥性反應。
3、嗜睡：頭疼藥中通常含有某些藥物成分，如複方氨酚烷胺片中的馬來酸氯苯那敏、氫溴酸右美沙芬片中的氫溴酸右美沙芬等，可能會對中樞神經系統產生一定的抑制作用，出現嗜睡的現象，另外在應用頭疼藥後，病情得到緩解，也可能出現嗜睡的現象。
