通常不存在治療幽門螺桿菌感染吃什麼藥最好的說法，治療幽門螺桿菌感染可以服用質子泵抑製劑、鉍劑、抗生素這三類藥物，構成四聯療法。具體分析如下：
1、質子泵抑制劑
幽門螺桿菌感染率較高，目前比較推薦四聯療法，四聯療法是根除幽門螺桿菌感染較爲有效的一種方法，即四種藥物同時服用，其中包括質子泵抑制劑，如奧美拉唑腸溶膠囊、埃索美拉唑腸溶片等藥物，通常需要選擇其中一種進行服用。
2、鉍劑
鉍劑是一種黏膜保護劑，是含鉍的藥物，如枸櫞酸鉍鉀片、複方鋁酸鉍顆粒等藥物，通常需要選擇其中一種進行服用。
3、抗生素
抗生素包括阿莫西林膠囊、克拉黴素膠囊、鹽酸左氧氟沙星膠囊、甲硝唑片、四環素片等藥物，通常需要選擇其中兩種進行服用。在選擇方面，建議其中一種選擇阿莫西林膠囊，因爲阿莫西林膠囊能夠有效根除幽門螺桿菌，並且耐藥性相對較小，需要注意的是，對阿莫西林膠囊過敏的患者不能服用。
治療時間通常爲14天，如果沒有不適反應，建議按照醫囑堅持服用藥物。
