山東魯抗醫藥大量偷排抗生素污水被媒體曝光後，製藥企業污染環境的問題再次受到關注。近年來，在環保問題上“栽跟頭”的製藥企業並不在少數，聯邦制藥、海正藥業等大型藥企不斷出現在環保部門督查整改名單中，有的甚至屢禁不止，頻頻上榜。
海正藥業
海正藥業作爲原料藥生產“大戶”是中國最大的抗生素、抗腫瘤藥物生產基地之一。2012年初，環保部公告顯示，海正藥業被查出“外排廢水COD超標排放，電纜溝積存高濃度污水;抗生素菌渣等危險廢物擅自出售給無資質的企業;與環保部門聯網的在線監測數據弄虛作假”等問題。
永安藥業
環保部《關於2011年環境保護部掛牌督辦環境違法案件的通知》指出，永安藥業1.4萬噸酒精法環氧乙烷生產裝置未批先建，並已投入生產，且污水處理站排水長期超標排放，現場檢查時弄虛作假。
聯邦制藥
今年年初，全球最大青黴素原料藥生產商聯邦制藥的青黴素、6-APA醫藥中間體新項目因下游環保處理設施長期超標排放未通過驗收被叫停。這是從2004年至今的10年時間裏，第9次被環保部門點名批評、減產限產甚至關停。
北方藥業
根據環保部2013年公佈的環境違法案件表顯示，內蒙古呼倫貝爾北方藥業有限公司(北方藥業)被“點名”的原因之一就在於其生產過程中的臭氣濃度均超過《惡臭污染物排放標準》(GB14554-1993)二級標準限值，超標倍數0.15-1.55倍。
嶺南製藥
廣東嶺南製藥有限公司的通報原因上寫着：現場採樣檢測結果顯示該企業排污口COD濃度爲2010mg/L、氨氮濃度爲2.07mg/L，屬嚴重超標;危險廢物轉移量和生產量不符，部分危險廢物、廢水處理污泥去向不明。
春蕾藥業
在2013年5月被掛牌督辦的18家環境違法問題較爲突出的企業中，廢水超標排放和廢物處理不當的製藥企業居於多數。吉林省延邊春蕾生物藥業有限公司的突出問題就是“大量廢棄的袋裝農藥和一般固體廢物混合露天堆放，無任何防護措施。現場檢查時污水處理廠未運行，廢水直接排放。”
東盛藥業
東盛科技股份有限公司製藥一廠違反建設項目環境保護管理規定，該廠頭孢氨苄車間2005年未經環保部門同意擅自投運，未完成竣工環保驗收。
高海藥業
藥企周邊不乏居民分佈。江蘇鎮江高海生物藥業有限公司的生產車間距離最近的居民樓不足100米，不符合衛生防護距離要求，也在通報之列。
醫藥製造行業污染物排放量大，治理難度高，特別是發酵類、化學合成類製藥企業，近年來成爲環境監管的重點。2010年7月開始實施的《製藥工業水污染物排放標準》爲國家首次發佈製藥工業污水排放標準，也是國家強制性標準。2013年5月，環境保護部、國家發展改革委、工業和信息化部等7部委聯合印發《關於2013年開展整治違法排污企業保障羣衆健康環保專項行動的通知》，將醫藥製造企業作爲排查整治的重點之一。
