跑步時右心房疼可能是因爲運動量過大、肋軟骨炎、肥厚性心肌病等原因導致，可通過一般治療、使用藥物、手術等方法治療，具體分析如下：
1、運動量過大
跑步的時候如果運動量過大可能導致心臟負荷過重，引發心肌缺血和疼痛等症狀，運動時需要量力而行，如出現身體部位不適，還需要多休息。
2、肋軟骨炎
肋軟骨炎是由於肋骨與肋軟骨連接處的軟骨組織發生炎症所致，炎症刺激神經末梢，導致疼痛。患者可在醫生的指導下使用雙氯芬酸鈉緩釋片、潑尼鬆片等非甾體抗炎藥、激素類藥物治療。
3、肥厚性心肌病
肥厚性心肌病是由於心肌增厚導致心臟結構和功能異常而引起的一種心臟疾病。運動時由於運動量加大，可能導致心臟負荷加重，引發心肌缺血和疼痛等症狀。患者可通過室間隔切除術、室間隔消融術等方法治療。
除以上原因，還有可能是因爲先天性心臟病、心力衰竭、心包腫瘤等原因導致。引起局部病變因素較多，還需要引起重視，及時就診。
