醫生利用腸鏡可以直觀看到腸道內部的情況，有利於腸道疾病的診斷。目前臨牀上常用的是電子結腸鏡，包括一般的腸鏡檢查和無痛腸鏡檢查。一般在出現便血、發現包塊、懷疑腸道腫瘤等情況下需進行腸鏡檢查。具體如下：
1.若出現便血需行鏡檢：如果在排便時發現大便中夾雜少量血絲或發現黑便需進行腸鏡檢查。
2.當腹部發現包塊需行鏡檢：若在腹部觸及明顯的包塊或不明原因的腫大時，需進行腸鏡檢查。
3.若懷疑腸道腫瘤需行進鏡檢：如果同時發現糞便中帶有少量血液或出現柏油狀的黑便，出現持續隱隱的腹痛導致吃飯吃不下且排不出大便，嘔吐不止。懷疑腸道腫瘤需進行腸鏡檢查作爲一個普查。
此外，一般無禁忌症可以進行腸鏡檢查，用來診斷腸道疾病或其他異常症狀。
